عمارت پنجم در سال 1244 هجري قمري توسط ملا محمد صالح برغاني قزويني حائري و با نظارت سردار حسن خان و حسين خان قزويني حائري و با نظارت سردار حسن خان و حسين خان قزويني انجام گشت كه تمامي عمارت سابق را خراب نمودند و آستانه مجللي با گنبد بزرگ كاشي كاري بنا كردند، كه شروع آن در سال 1244 هجري قمري و پايان عمارت در سال 1250 هجري قمري بود.

تاريخ مذكور بر روي سنگ مرمر به خط ثلث در دو طرف ايوان آستانه نصب است. سيد حسن امين بر آن است كه در سال 1250 هجري قمري سردارحسين خان آن را تعمير نموده و اين عمارت در سال 1310 قمري توسط ميرزا حسين نوري تعمير گشت و قسمت هايي از كاشي كاري گنبد كه ريخته بود، مرمت شد و تاريخ آن در پيشاني گنبد ثبت شده و هشت حجره در جنوب صحن شريف جهت سكونت زائرين احداث گرديده بود.

پس از هجرت ميرزاي شيرازي رحمه الله به سامرا، در يكي از مسافرت هاي ميرزا كه همراه شاگردانش پياده از سامرا به آستانه سيد محمد مشرف گشتند، تعميراتي انجام داده و چند حجره به حجرات صحن افزودند. سپس ميرزا محمد تهراني عسكري صحن شريف را توسعه داد و حجراتي بدان اضافه نمود.